More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1887 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 876 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 876 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 884 aa  974    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 875 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 880 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 876 aa  799    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 865 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 880 aa  878    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  72.82 
 
 		 872 aa  1321    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 874 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 875 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  880    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 880 aa  871    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 892 aa  678    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  878    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  879    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 877 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 878 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  878    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 879 aa  741    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 879 aa  722    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 880 aa  860    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 875 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 882 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 897 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 878 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 876 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 875 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 864 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 879 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 883 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 896 aa  650    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 879 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 881 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 874 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 875 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 880 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 860 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 876 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 876 aa  689    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 877 aa  871    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 880 aa  879    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 897 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 880 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 876 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 876 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 878 aa  865    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 874 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 878 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 876 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 880 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 880 aa  877    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 872 aa  1788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 885 aa  952    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 882 aa  926    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 893 aa  920    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  71.56 
 
 		 872 aa  1309    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 897 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 880 aa  878    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.43 
 
 		 876 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 878 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 892 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 931 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 863 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 876 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 875 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 875 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 859 aa  634  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 879 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 876 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 860 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 875 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 860 aa  631  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 874 aa  632  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 872 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 874 aa  628  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 874 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>