More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl613 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
884 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
877 aa  658    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
876 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
880 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
880 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
872 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
880 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
880 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
892 aa  1825    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
880 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
876 aa  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
880 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
880 aa  661    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
880 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  66.15 
 
 
896 aa  1212    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
880 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
878 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
880 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf202  alanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
885 aa  645    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.333605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
880 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
872 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
885 aa  648    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
882 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
893 aa  635    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
872 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
876 aa  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
879 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0378  alanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
906 aa  622  1e-176  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.814395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
876 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  37.46 
 
 
876 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
863 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
878 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
879 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
875 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
875 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
883 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
876 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
880 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
876 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
892 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
876 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
876 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
876 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
876 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
863 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
870 aa  551  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  37 
 
 
874 aa  550  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
874 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
879 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
874 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
874 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
875 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
877 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
878 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
875 aa  545  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
874 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
860 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
878 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
875 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
875 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
860 aa  542  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
876 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
892 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
874 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
874 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
874 aa  542  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  36 
 
 
897 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
860 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
874 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
880 aa  538  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
903 aa  539  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
897 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
875 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
860 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
897 aa  539  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
875 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
874 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
899 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
874 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
865 aa  532  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
874 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
874 aa  532  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
874 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
884 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
874 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
874 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
865 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
867 aa  531  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
860 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>