More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0378 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0378  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
906 aa  1867    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.814395  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
896 aa  656    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
892 aa  622  1e-176  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf202  alanyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
885 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.333605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
872 aa  567  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
872 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
872 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
876 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
876 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
876 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
877 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
880 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
880 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
880 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
880 aa  532  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
880 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
880 aa  532  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
880 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
879 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
880 aa  532  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
882 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
880 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
880 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
880 aa  522  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
878 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
878 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
885 aa  516  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
883 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
860 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
874 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
874 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
876 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
874 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 
893 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
897 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
884 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
874 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
860 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
897 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
877 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
874 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
897 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
874 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
874 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 
874 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
874 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
880 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
884 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 
860 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
878 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 
875 aa  492  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
878 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
876 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
876 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
876 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
876 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
876 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
876 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
869 aa  489  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
876 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
876 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
876 aa  485  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
876 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  33.19 
 
 
876 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
876 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
876 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
876 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
880 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
874 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
876 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
860 aa  482  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
879 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
859 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
870 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 
863 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
874 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
903 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
874 aa  479  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
874 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 
863 aa  479  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
879 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
870 aa  478  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
877 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
874 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
865 aa  479  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
874 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
877 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
874 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
874 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
874 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
874 aa  476  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
874 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
874 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>