More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0421 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 876 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 876 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 876 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 875 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 875 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 876 aa  889    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 867 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 892 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 863 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 		 880 aa  931    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 872 aa  946    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 880 aa  922    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 880 aa  929    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 880 aa  929    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 892 aa  665    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 		 880 aa  931    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 897 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 874 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 875 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 899 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 904 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 878 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 877 aa  735    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 876 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 897 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 878 aa  712    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 874 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 905 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 882 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 897 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 876 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 880 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 864 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 880 aa  929    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 876 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 880 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 892 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 896 aa  662    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 876 aa  680    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 881 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 874 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 905 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 876 aa  901    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 860 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 874 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 863 aa  675    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 876 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 875 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 863 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 867 aa  649    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 865 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 874 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 875 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 868 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 876 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 884 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 884 aa  1066    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 		 880 aa  933    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 876 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 897 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 897 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 865 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 876 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 880 aa  719    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 879 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 879 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 874 aa  681    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 865 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 876 aa  640    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 879 aa  708    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 874 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 874 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 880 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 874 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 874 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 874 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 872 aa  936    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 885 aa  998    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 882 aa  1816    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 893 aa  1010    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 872 aa  959    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 897 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 874 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 874 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 875 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 876 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 878 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 903 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 859 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 876 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 876 aa  901    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 876 aa  677    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 879 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>