More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0493 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  685    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 879 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 875 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 877 aa  868    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 876 aa  825    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 876 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 880 aa  852    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 876 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 860 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  82.57 
 
 		 872 aa  1504    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 874 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 874 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 880 aa  851    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 880 aa  848    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 892 aa  675    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 880 aa  851    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 892 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 875 aa  658    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 860 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 879 aa  739    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  683    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 876 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 876 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 865 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 875 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 892 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 876 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 880 aa  853    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 876 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 882 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 880 aa  850    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 876 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 875 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 864 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 880 aa  851    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 874 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 874 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 896 aa  651    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 880 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 881 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 878 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  44.01 
 
 		 876 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 878 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 876 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 883 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 879 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 874 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 876 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 876 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 874 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 884 aa  967    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 872 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 880 aa  851    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 892 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 878 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 874 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 865 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 863 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 875 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 879 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 879 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 874 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 874 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 874 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 874 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 880 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 880 aa  851    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 874 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  71.56 
 
 		 872 aa  1315    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 885 aa  941    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 882 aa  952    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 893 aa  892    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 872 aa  1798    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 877 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 878 aa  848    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 880 aa  840    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 860 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 874 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 874 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 878 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 876 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 876 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 900 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 874 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 876 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 879 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 880 aa  853    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 874 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>