More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0159 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
880 aa  656    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
878 aa  656    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
876 aa  661    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
877 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
880 aa  653    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
880 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
872 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
880 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
880 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  66.15 
 
 
892 aa  1212    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
880 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
880 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf202  alanyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
885 aa  650    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.333605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
880 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
896 aa  1825    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
880 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
880 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
884 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
876 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0378  alanyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
906 aa  656    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.814395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
880 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
872 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
885 aa  636    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
882 aa  653    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
872 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
876 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
893 aa  623  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
879 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
876 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
863 aa  581  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
863 aa  582  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
878 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
877 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
878 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
883 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
876 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
876 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
876 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
876 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
867 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  36.05 
 
 
876 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  552  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
876 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  552  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
876 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
856 aa  551  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
870 aa  546  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
875 aa  549  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
876 aa  547  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
874 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
859 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
879 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
878 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
892 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
863 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
875 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
879 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
879 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
903 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
874 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
875 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
874 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
874 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
875 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
874 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
875 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
860 aa  522  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
879 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
876 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
874 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
875 aa  522  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
882 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
875 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
875 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
880 aa  522  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
865 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
860 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
897 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
864 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
876 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
897 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
865 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
874 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
874 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
897 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
874 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
874 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
880 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
880 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
880 aa  515  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
874 aa  515  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
876 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>