More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1167 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
877 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
876 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
878 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
876 aa  824    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
880 aa  880    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
879 aa  757    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
872 aa  919    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
876 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
879 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
880 aa  879    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
880 aa  879    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
892 aa  648    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
880 aa  879    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
879 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
876 aa  843    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
883 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
877 aa  884    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
863 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
897 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
878 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
876 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
864 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
880 aa  879    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
880 aa  879    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
878 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
896 aa  636    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
881 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
876 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 
875 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
881 aa  645    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
874 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
880 aa  878    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
874 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
884 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
874 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
897 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
880 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
880 aa  868    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
879 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
879 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
874 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
880 aa  881    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
876 aa  843    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
859 aa  638    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
878 aa  902    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
874 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
880 aa  879    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
874 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
872 aa  952    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
885 aa  1816    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
882 aa  985    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 
893 aa  1175    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
872 aa  932    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
897 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
884 aa  1058    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
880 aa  879    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
863 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
878 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
874 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
874 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
880 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
874 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
892 aa  635  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
874 aa  635  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
882 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
882 aa  629  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
874 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
874 aa  625  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
874 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
875 aa  623  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
880 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
876 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
876 aa  625  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
867 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
876 aa  622  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
876 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
876 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
874 aa  622  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
874 aa  616  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
880 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
874 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
885 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
931 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
905 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>