More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1052 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
876 aa  1009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
876 aa  1009    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0125  alanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
875 aa  647    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
871 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
875 aa  894    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
874 aa  959    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
876 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
876 aa  724    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 
867 aa  1017    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
877 aa  802    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
884 aa  946    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
880 aa  710    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
876 aa  930    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
842 aa  726    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
885 aa  886    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
874 aa  966    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
874 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
880 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
880 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
880 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
874 aa  972    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
860 aa  990    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
860 aa  997    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 
899 aa  988    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 
890 aa  902    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  57.13 
 
 
871 aa  969    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
889 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
886 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
874 aa  999    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0146  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
891 aa  712    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00216765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 
886 aa  1011    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
891 aa  889    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
880 aa  731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
874 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  61.67 
 
 
873 aa  1049    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
874 aa  968    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
883 aa  871    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
882 aa  927    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
897 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
887 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
899 aa  703    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
886 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2518  alanyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
889 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
876 aa  888    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
880 aa  848    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 
864 aa  1025    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
880 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1898  alanyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
851 aa  737    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.352865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
886 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
899 aa  734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 
862 aa  980    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
883 aa  871    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
881 aa  828    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
874 aa  950    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
905 aa  820    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
891 aa  861    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
881 aa  906    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
848 aa  660    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0981  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
887 aa  701    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
884 aa  828    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
876 aa  941    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
875 aa  981    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
890 aa  878    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 
874 aa  988    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
878 aa  934    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
874 aa  1003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
874 aa  987    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
891 aa  878    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
868 aa  1007    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
897 aa  885    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
890 aa  927    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
884 aa  1010    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
884 aa  851    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
902 aa  877    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1720  alanyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
884 aa  889    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
897 aa  991    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 
865 aa  1005    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
909 aa  851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
877 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
879 aa  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
879 aa  717    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
874 aa  959    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
874 aa  708    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
874 aa  972    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
874 aa  972    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
869 aa  1036    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
874 aa  967    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
880 aa  811    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
884 aa  842    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
874 aa  996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
874 aa  993    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
892 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
897 aa  994    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
885 aa  873    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 
878 aa  966    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
874 aa  972    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
886 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
845 aa  749    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
878 aa  879    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
888 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>