More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0368 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 889 aa  1835    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 896 aa  549  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 923 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 910 aa  544  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 892 aa  541  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 892 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 892 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 892 aa  532  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 892 aa  526  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 892 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 923 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 913 aa  515  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 916 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 926 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 924 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 913 aa  505  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 899 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 926 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 914 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 907 aa  488  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 915 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 900 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 925 aa  469  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 882 aa  468  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 913 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 904 aa  462  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 926 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 870 aa  262  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 865 aa  252  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 878 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 859 aa  243  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 863 aa  231  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 877 aa  231  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 863 aa  230  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 876 aa  229  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 874 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 883 aa  227  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 867 aa  227  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 878 aa  225  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 884 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 885 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 870 aa  222  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 872 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 897 aa  220  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 890 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 896 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 876 aa  219  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 897 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 897 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 872 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 874 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 874 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 891 aa  218  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 		 878 aa  218  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 879 aa  217  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 864 aa  217  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 863 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 879 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 891 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 891 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 869 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 879 aa  214  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 876 aa  214  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 878 aa  214  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 876 aa  214  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 876 aa  214  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 883 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 886 aa  213  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 874 aa  213  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 884 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 885 aa  213  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 904 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 886 aa  212  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 874 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 874 aa  211  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 876 aa  211  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 886 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 878 aa  211  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 897 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 874 aa  211  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 874 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 869 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 887 aa  210  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 874 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 865 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 872 aa  209  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 885 aa  208  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 860 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 874 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 880 aa  208  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 879 aa  208  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 860 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  26.21 
 
 		 873 aa  207  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 893 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 874 aa  207  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 884 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 895 aa  207  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 848 aa  207  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 885 aa  207  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>