More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1361 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 910 aa  788    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 892 aa  782    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 926 aa  895    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 882 aa  750    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 914 aa  984    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 926 aa  857    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 913 aa  1018    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 924 aa  852    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 923 aa  1912    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 916 aa  1011    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 926 aa  851    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 892 aa  780    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 892 aa  650    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  69.67 
 
 		 923 aa  1403    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 896 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 899 aa  659    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 915 aa  969    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 913 aa  1147    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 892 aa  780    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 892 aa  782    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 913 aa  949    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 907 aa  642    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 925 aa  873    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 892 aa  615  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 900 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 904 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 889 aa  545  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 880 aa  331  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 877 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 878 aa  320  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 879 aa  318  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 879 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 875 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 878 aa  310  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 897 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 897 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 876 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 874 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 876 aa  303  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 874 aa  303  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 897 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 870 aa  302  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 876 aa  301  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 874 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 874 aa  298  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 874 aa  297  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 874 aa  296  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 883 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 874 aa  294  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 859 aa  294  5e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 904 aa  294  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 874 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 879 aa  292  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 874 aa  291  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 879 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 863 aa  290  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 879 aa  290  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 876 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 875 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 864 aa  289  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 863 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 876 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 880 aa  288  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 905 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 874 aa  287  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 865 aa  288  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 885 aa  287  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 878 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 874 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 874 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 878 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 882 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 874 aa  285  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 879 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 870 aa  283  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 878 aa  283  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 863 aa  282  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 882 aa  282  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 877 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 886 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 888 aa  281  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 888 aa  281  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 886 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 876 aa  280  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 905 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 869 aa  280  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 893 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 874 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 899 aa  278  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 905 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>