More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0744 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
876 aa  1065    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
876 aa  1064    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
876 aa  967    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
871 aa  682    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
875 aa  850    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
874 aa  1013    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
876 aa  647    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
876 aa  689    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
867 aa  1011    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
877 aa  728    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  94.34 
 
 
884 aa  1707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
880 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
876 aa  957    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
842 aa  692    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
885 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
874 aa  1026    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
874 aa  1036    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
880 aa  664    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
880 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
880 aa  660    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  76.93 
 
 
874 aa  1357    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
860 aa  932    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
860 aa  938    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
899 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
890 aa  941    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 
871 aa  1210    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
880 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 
874 aa  1232    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  79.55 
 
 
874 aa  1449    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
891 aa  663    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00216765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  73.64 
 
 
886 aa  1300    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
891 aa  839    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
880 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  77.05 
 
 
874 aa  1360    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  57.29 
 
 
873 aa  972    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
874 aa  1013    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
883 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
882 aa  833    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  75.68 
 
 
897 aa  1386    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
887 aa  666    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
899 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
886 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
879 aa  832    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
876 aa  847    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
880 aa  817    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
864 aa  1009    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
880 aa  664    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1898  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
851 aa  685    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.352865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
886 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
899 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 
862 aa  1150    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
883 aa  781    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
881 aa  783    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  77.05 
 
 
874 aa  1333    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
905 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
867 aa  911    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 
891 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
881 aa  805    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0981  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
887 aa  657    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
884 aa  798    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  69.75 
 
 
876 aa  1247    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
875 aa  1003    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
890 aa  822    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  69.89 
 
 
874 aa  1241    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  71.75 
 
 
878 aa  1254    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  77.05 
 
 
874 aa  1413    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 
874 aa  1034    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
891 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  59.77 
 
 
868 aa  1003    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
897 aa  832    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
890 aa  946    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  80.07 
 
 
884 aa  1468    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
884 aa  896    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
902 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1720  alanyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
884 aa  792    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  75.9 
 
 
897 aa  1387    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
865 aa  1011    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
909 aa  781    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
877 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
879 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
879 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
874 aa  1003    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
874 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
874 aa  1024    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 
874 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 
869 aa  986    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
874 aa  1027    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
880 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
884 aa  768    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  75.8 
 
 
874 aa  1382    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
874 aa  1042    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  76.02 
 
 
897 aa  1390    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
885 aa  784    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
878 aa  885    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
874 aa  1021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
886 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
845 aa  735    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
878 aa  806    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
888 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
885 aa  822    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>