More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0885 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0885  type II secretion system protein  100 
 
 
400 aa  753    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3408  type II secretion system protein  40 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  40.6 
 
 
401 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  33.25 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0546  type IV pilus assembly protein PilC  39.07 
 
 
401 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0642  type II secretion system protein  34.41 
 
 
401 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.4 
 
 
402 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  29.4 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  32.33 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.72 
 
 
421 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  29.31 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.35 
 
 
420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.35 
 
 
424 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.21 
 
 
419 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.72 
 
 
422 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.2 
 
 
408 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.97 
 
 
403 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.47 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  28.82 
 
 
408 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.25 
 
 
420 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0114  type II secretion system protein  38.37 
 
 
411 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.089481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28.21 
 
 
421 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  26.9 
 
 
405 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  31.3 
 
 
398 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 
398 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  31.3 
 
 
398 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 
398 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 
398 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.32 
 
 
419 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  25.38 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  27.57 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  30.83 
 
 
401 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  28.68 
 
 
405 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.98 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.39 
 
 
422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  29.31 
 
 
419 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  29.32 
 
 
402 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.94 
 
 
401 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.9 
 
 
405 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  27.89 
 
 
405 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.11 
 
 
402 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  31.02 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  30.75 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.32 
 
 
423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  29.15 
 
 
402 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  30.08 
 
 
422 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  26.5 
 
 
407 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  28 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  26.34 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  30.79 
 
 
409 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.64 
 
 
423 aa  179  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  27.02 
 
 
419 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  27.53 
 
 
463 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  27.82 
 
 
422 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  29.85 
 
 
410 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.82 
 
 
419 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  27.27 
 
 
463 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  26.46 
 
 
402 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.43 
 
 
408 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  27.96 
 
 
421 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  29.82 
 
 
405 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  29.77 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  27.46 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.57 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  27.64 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28.36 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  27.73 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28.36 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  29.58 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  28.14 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  27.64 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  25.95 
 
 
408 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  27.14 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  25.81 
 
 
404 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0873  type II secretory pathway, PilC-like  31.45 
 
 
403 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  28.97 
 
 
417 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  31.2 
 
 
401 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  28.64 
 
 
406 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  31.67 
 
 
405 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  26.07 
 
 
417 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  29.75 
 
 
406 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  33.5 
 
 
405 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  32.18 
 
 
405 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.76 
 
 
417 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  30.81 
 
 
409 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  27.42 
 
 
408 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  26.47 
 
 
410 aa  170  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  28.4 
 
 
405 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  31.92 
 
 
405 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  32.65 
 
 
433 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.14 
 
 
401 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.34 
 
 
407 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  26.77 
 
 
412 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  26.74 
 
 
407 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  28.32 
 
 
405 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  25.33 
 
 
407 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  29.25 
 
 
408 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  24.88 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  25.97 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  27.36 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>