More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0642 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0642  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  816    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  39.45 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0546  type IV pilus assembly protein PilC  37.81 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3408  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  37.56 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.92 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  31.81 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.71 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 405 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0885  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 407 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.09 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  28.09 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.88 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.23 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  31.83 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  31.04 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.3 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.67 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.3 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.06 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.53 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  31.33 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.65 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  27.72 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  29.63 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  28.4 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  29 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  29 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.5 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.09 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  28.36 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  29.56 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  28.32 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  28.32 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  28.32 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  28.32 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  28.18 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  27.68 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.57 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.66 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  30.42 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  25.81 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  29.11 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  29.14 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  28.32 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  29.14 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  28.82 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  27.23 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 409 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  26.7 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.25 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  28.57 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  28 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>