119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3292 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  100 
 
 		 163 aa  308  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  74.5 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  68.79 
 
 		 254 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  64.97 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  59.75 
 
 		 222 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  58.39 
 
 		 194 aa  161  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  60.14 
 
 		 220 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  54.14 
 
 		 357 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  51.88 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  50.84 
 
 		 226 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  51.55 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  56.77 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  55.92 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  52.67 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  59.73 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  53.85 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  50.67 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  50.65 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  46.75 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  49.01 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  44.81 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  47.77 
 
 		 338 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  47.02 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  47.59 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  47.59 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  46.9 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  46.9 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  51.35 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  51.85 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  41.67 
 
 		 198 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  52.54 
 
 		 257 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  42 
 
 		 217 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  40.13 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 253 aa  84.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  44.54 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  36.75 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 210 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  26.49 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  39.04 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.39 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  37.24 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  37.58 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.33 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  35.46 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  26.92 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  32.12 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.9 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.9 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  22.48 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  35.21 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  36.5 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  27.92 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.96 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  31.43 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  41.76 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  24.73 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  28.85 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  24.84 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.61 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  20.14 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  31.36 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  39.24 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  24.81 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  29.7 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  25.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  24.29 
 
 		 269 aa  44.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  25.69 
 
 		 233 aa  44.7  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  24.82 
 
 		 224 aa  44.3  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  38.98 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  22.82 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  22.82 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  22.82 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>