138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1786 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  100 
 
 		 198 aa  381  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  50.32 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  48.37 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  45.75 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  42.01 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  47.95 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  42.24 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  46.01 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  42.24 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  41.61 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  44 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  43.48 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  49.01 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  42.77 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  40.13 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  46.15 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  42.33 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  41.67 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  42.14 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  38.67 
 
 		 220 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  39.55 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  41.29 
 
 		 254 aa  94.4  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  43.48 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  38.24 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  43.48 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  41.22 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  41.57 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  37.85 
 
 		 357 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  37.93 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  41.56 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  46.04 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  36.43 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  35.8 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  37.24 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  33.79 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  35.16 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  35.94 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  40.52 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  35.14 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.24 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.24 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  36.72 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  32.68 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  37.78 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  40.21 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  40.57 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  40 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.56 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.91 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  35.42 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.49 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  31.17 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  35.94 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  36.84 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 154 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  36.09 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  27.73 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  33.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.55 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  28.47 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  36.09 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  33.59 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  24.09 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  33.59 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  32.23 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.57 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  35.16 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  35.51 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  32.05 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  34.59 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  32.92 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  31.67 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  21.32 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  30.4 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  30.4 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  27.63 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  30.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>