132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3993 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  100 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  52.23 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  50.93 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  44.6 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  47.77 
 
 		 220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  43.6 
 
 		 192 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  52.03 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  52.32 
 
 		 186 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  48.12 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  43.53 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  48.03 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  43.02 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  50 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  48.37 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  44.44 
 
 		 194 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  40.51 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  43.39 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  45.39 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  41.71 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.19 
 
 		 183 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  44.77 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  44.77 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  41.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  47.26 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  45.51 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  35.92 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  49.01 
 
 		 167 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  41.36 
 
 		 174 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  40.67 
 
 		 160 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  47.01 
 
 		 137 aa  92.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  38.41 
 
 		 170 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  42.58 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  39.38 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.22 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  31.41 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  35 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.08 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  35.24 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  36.57 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  33.13 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.66 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  35.86 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  39.09 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  37 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.99 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.9 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.21 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  23.81 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  24.68 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  32.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  39.05 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  21.85 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  31.25 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  23.68 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.46 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  39.05 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  33.73 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  39.39 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  39.53 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  34.95 
 
 		 156 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.45 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  32.4 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  22.64 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  22.08 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.24 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  22.6 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  37.67 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.08 
 
 		 166 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  34.15 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  33.06 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  26.15 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  35.96 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  30.08 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  30.08 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>