103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1311 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  30.39 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  29.83 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  31.79 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  35.77 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  22.86 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  30 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.54 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  24.42 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  22.76 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  23.43 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.82 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  24.35 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  28.04 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  21.16 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.97 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.73 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  24.19 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  37.01 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  23.68 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  21.6 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  24.09 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  28.14 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  27.85 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  22.6 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  27.68 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  27.78 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  26.63 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  23.56 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  27.13 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  30.72 
 
 		 168 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  24.11 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  24.11 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  24.11 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.8 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  23.23 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 267 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  35.09 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  24.16 
 
 		 160 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  17.46 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  22.6 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  24.65 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  27.7 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  23.49 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  24.65 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  26.95 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 272 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 272 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  18.09 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  25.5 
 
 		 161 aa  48.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  24.32 
 
 		 357 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  26.11 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  25.5 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  26.09 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  22.56 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  20.28 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  21.02 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  24.5 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  23.31 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  22.06 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  22.61 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  17.49 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  28 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  24.64 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  25.47 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  21.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  25.45 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  27.66 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  21.01 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  21.3 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  19.23 
 
 		 338 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  20.55 
 
 		 202 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>