99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3046 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  51.05 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  47.22 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  46 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  44.44 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  41.73 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  45.39 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  40.94 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  35.77 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  32.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  32.08 
 
 		 212 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  26 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  26.95 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  22.48 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  22.22 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  24.63 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  29.14 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  21.92 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  28.15 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  32.09 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  26.76 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  29.55 
 
 		 269 aa  50.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.01 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.43 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  23.49 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  26.9 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.45 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  32.09 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  29.33 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.29 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.77 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  28.77 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  21.32 
 
 		 357 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  29.17 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  25.52 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  20.93 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  22.3 
 
 		 214 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  23.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  28.99 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  23.08 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  25.47 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  29.32 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.73 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  20.25 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  21.97 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  23.26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  30.85 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.83 
 
 		 267 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  22.73 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  21.51 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  24.66 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  24.22 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  26.76 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  26.76 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  25.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  25.48 
 
 		 166 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  24.43 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  26.52 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  27.64 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  21.13 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.32 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  25.31 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  25.31 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  25.31 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  24.14 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 253 aa  40.8  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  23.24 
 
 		 264 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  24.14 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>