78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1698 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  43.3 
 
 
267 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  37.3 
 
 
264 aa  158  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  35.02 
 
 
270 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  35.96 
 
 
270 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  34.46 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  34.08 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.74 
 
 
271 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  32.3 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  33.19 
 
 
267 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  35.1 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  35.1 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  29.71 
 
 
269 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  34.11 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  30.27 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.55 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.92 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.65 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  24.38 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.1 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  30.66 
 
 
212 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  30.19 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  26.54 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.19 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  24.76 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.7 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  23.56 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  26.8 
 
 
178 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  25 
 
 
221 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  33.9 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  22.12 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  24.76 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.2 
 
 
163 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.45 
 
 
151 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  28.97 
 
 
161 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  26.95 
 
 
163 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.12 
 
 
217 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  24.31 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.28 
 
 
161 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
152 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  28.57 
 
 
162 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.78 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.28 
 
 
152 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  23.97 
 
 
151 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  27.34 
 
 
156 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  21.74 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  23.36 
 
 
159 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  23.02 
 
 
161 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  25.66 
 
 
151 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  26.87 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.71 
 
 
150 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  29.55 
 
 
129 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.67 
 
 
150 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.57 
 
 
149 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  25.68 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  26.12 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  24.82 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  25 
 
 
179 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  28.67 
 
 
150 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  27.78 
 
 
152 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  26.97 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  23.29 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.85 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  23.6 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  26.09 
 
 
159 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  27.41 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  29.13 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  23.53 
 
 
161 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  27.15 
 
 
164 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  25.17 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  20.62 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>