100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1378 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  41.6 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  37.3 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  37.26 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  34.6 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  36.12 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  35.74 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  35.74 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  35.74 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  35.36 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  35.36 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  35.36 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  35.36 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  34.6 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  36.09 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  35.19 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  35.11 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  27.97 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  29.12 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.9 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.4 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  35.06 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.63 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  28.07 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  25.53 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.19 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.98 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  24.84 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  23.03 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  25 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  25.66 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  30.69 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.55 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  26.63 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  34.41 
 
 		 129 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  32 
 
 		 156 aa  52.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  25.18 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 223 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  24.85 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  24.84 
 
 		 163 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  25 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  25.16 
 
 		 167 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  25.47 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  21.24 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  27.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  27.48 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  28.23 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  25.18 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  23.23 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  28.35 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  27.03 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  27.94 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 167 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  32.94 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.17 
 
 		 152 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27 
 
 		 151 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 161 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  26.35 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.32 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  28.36 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  27.67 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  29.92 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.13 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  26.97 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  26.15 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  26.87 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  22.76 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  24.29 
 
 		 178 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  24.36 
 
 		 177 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  26.6 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  27.69 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  28.46 
 
 		 161 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>