14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0228 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  100 
 
 		 270 aa  557  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  85.87 
 
 		 269 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  84.01 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  83.27 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  80.37 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  47.89 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  33.51 
 
 		 220 aa  99  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  28.35 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 152 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  35.48 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  27.01 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>