20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1595 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  84.01 
 
 		 269 aa  477  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  83.27 
 
 		 269 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  84.01 
 
 		 270 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  75.46 
 
 		 270 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  48.46 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.71 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.45 
 
 		 149 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  39.78 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 151 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  34.31 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.42 
 
 		 601 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  27.49 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30.7 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  25.19 
 
 		 152 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>