160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3177 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  44.9 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  44.74 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  40.58 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  42.76 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  34.33 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  36.64 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  36.13 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  30 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  34.25 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  39.85 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  36 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  28.85 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.48 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.13 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  32.14 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  33.12 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  38.62 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  33.54 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  33.54 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  34.64 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  32.26 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.72 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  34.19 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.67 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  31.82 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  33.07 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.24 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  29.27 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  31.61 
 
 		 289 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  22.76 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  30.61 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  29.79 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  26.8 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30.61 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 327 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  32.08 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 325 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  30.63 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  26.75 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  28.76 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.47 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  20.83 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  28.74 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  31.51 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  31.51 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.35 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  27.17 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  38.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  19.18 
 
 		 258 aa  47.8  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  27.45 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  38.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  26.15 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  22.58 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  29.87 
 
 		 262 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  30.52 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>