131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2629 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  33.51 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  28.71 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  30.89 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  33.98 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  30.89 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  33.79 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  34.16 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  35.29 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  32.64 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 156 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  33.09 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.86 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  31.85 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  28.28 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  28.26 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  30.85 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 149 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 152 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  27.16 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  23.94 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.38 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  40.23 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  27.97 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  36.17 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  25.36 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  30 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  25.36 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  23.78 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  25 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  25.36 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  28.75 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  28.1 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28.23 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  27.91 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  28.87 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  28.06 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  27.66 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  27.41 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  24.67 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  28.36 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  25.58 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  28.38 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  24.72 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  28.29 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  27.86 
 
 		 154 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  25 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  25 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4386  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.684002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  23.88 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  25 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  30.59 
 
 		 150 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  28.32 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  25.34 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  25.19 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  28 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  21.13 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  21.66 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  30.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  27.86 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.94 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>