184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3737 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  100 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  89.47 
 
 		 156 aa  273  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  50.34 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  43.54 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  40.58 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  42.36 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  42.22 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  41.18 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.27 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  35.81 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  32.14 
 
 		 220 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  34.25 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  34.25 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.67 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  34.25 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  37.24 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  34.72 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  35.53 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  31.43 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  32.03 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  37.16 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.85 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  33.97 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  39.86 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  31.88 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  37.78 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  31.94 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  33.56 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.86 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  32.14 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  38.03 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  33.56 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  28.35 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.57 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  26.17 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  25.68 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  31.13 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  35.82 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  40.91 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  35.82 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  29.2 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  33.1 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  31.94 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>