15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2970 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  83.64 
 
 		 269 aa  480  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  83.27 
 
 		 269 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  83.27 
 
 		 270 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  76.95 
 
 		 270 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  48.85 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  30.89 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 156 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  38.71 
 
 		 162 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  29.93 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  29.92 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 163 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 601 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  23.53 
 
 		 152 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>