220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3631 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  41.18 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  44.85 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  45.65 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  40.76 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  44.2 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  40.14 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  41.61 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  41.61 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  37.96 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  41.55 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  39.47 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  40.82 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  36.49 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  41.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  40.82 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  40.82 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  36.3 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  33.56 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  40.14 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  40.82 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  35.37 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  36.91 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  37.41 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  36.81 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  36.11 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  37.41 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  39.31 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  38.69 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  36.23 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  40.16 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  36.76 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  38.3 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  39.01 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  34.25 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  37.23 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  38.85 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.66 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  35.46 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  37.6 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  32.94 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  42.72 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  39.71 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  39.71 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  36.84 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  37.41 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  35.56 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  36.64 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  38.24 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  35.34 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  31.9 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  36.5 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  35.94 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  32.92 
 
 		 411 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  31.9 
 
 		 373 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  39.55 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  34.48 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  37.78 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  32.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  34.04 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  32.89 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  34.64 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>