174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0071 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  100 
 
 
152 aa  306  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  55.17 
 
 
155 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  54.48 
 
 
155 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  44.85 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  41.3 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  42.07 
 
 
152 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  36.36 
 
 
150 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  36.03 
 
 
161 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  38.24 
 
 
156 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  36.42 
 
 
155 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  38.62 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  39.72 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  36.3 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  41.48 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  39.47 
 
 
168 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  37.35 
 
 
182 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  36.3 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  35.77 
 
 
156 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  36.24 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  35.42 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  36.26 
 
 
187 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  35.42 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.88 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  38.85 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.19 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  37.86 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  32.9 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  36.15 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  36.15 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  38.93 
 
 
150 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  37.4 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  36.99 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  36.99 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  37.14 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  35.81 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  38.73 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  32.19 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  35.17 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  37.96 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  32.41 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  36.64 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  33.1 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  36.91 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  33.1 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  36.11 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  36.11 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  36.11 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  33.58 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  36.03 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  33.79 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  35.42 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.57 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  35.42 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  34.13 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  36 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  34.13 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  33.55 
 
 
411 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  32.85 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  32.7 
 
 
373 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  32.85 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  37.86 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  32.92 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.41 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  36.5 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.57 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.81 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  34.26 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  32.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.53 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  35.78 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  33.59 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  33.59 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  34.25 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  30.16 
 
 
224 aa  63.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  34.88 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  33.58 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  34.53 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  32 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  33.8 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  32.74 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  32.61 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  30.87 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  31.34 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.28 
 
 
206 aa  60.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  32.84 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  35.56 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  32.14 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.59 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  27.89 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  34.33 
 
 
289 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  34.33 
 
 
293 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  31.61 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>