141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2148 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  100 
 
 		 183 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  100 
 
 		 183 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  98.36 
 
 		 183 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  71.81 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  70.27 
 
 		 184 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  64.84 
 
 		 174 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  45.51 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  45.73 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  42.24 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  46.63 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  41.95 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  44.51 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  43.83 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  44 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  46.25 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  46.41 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  47.59 
 
 		 163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  46.1 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  45.33 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  41.71 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  44.38 
 
 		 338 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  45.51 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  51.03 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  46.31 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  38.01 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  41.03 
 
 		 357 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  39.16 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  46.15 
 
 		 257 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  42.17 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  40.79 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  42.67 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  38.13 
 
 		 228 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  46.67 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  39.72 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  45.71 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  42.42 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  34.88 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  34.45 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  36.05 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  42.73 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  26.12 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.8 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.74 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.82 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  33.67 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  27.86 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  37.88 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  25.32 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  35.19 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  33.77 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  29.22 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  40 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  36 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  37.06 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.17 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  35.82 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  27.59 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  33.99 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  32.19 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  24.52 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  25.16 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.2 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  35.61 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  40.43 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  41.38 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  27.94 
 
 		 271 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.11 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.77 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  35.71 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  36.96 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>