81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0412 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  100 
 
 
258 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  57.75 
 
 
258 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  45.63 
 
 
269 aa  218  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  37.16 
 
 
267 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  37.93 
 
 
272 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  37.93 
 
 
272 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  31.4 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  30.74 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  34.11 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  28.52 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  26.91 
 
 
271 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  24.69 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.52 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  28.14 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  27.52 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  27.91 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  27.03 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.02 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.72 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  22.69 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  18.45 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.85 
 
 
152 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  20.66 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.57 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  21.78 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.1 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  29.37 
 
 
152 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  21.74 
 
 
157 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  24.65 
 
 
156 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  27.61 
 
 
158 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  23.7 
 
 
153 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  23.87 
 
 
157 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  25 
 
 
156 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  20.57 
 
 
167 aa  52  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  18.42 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  22.96 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  25.35 
 
 
150 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  23.41 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  19.84 
 
 
155 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  25.19 
 
 
151 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  29.25 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  22.44 
 
 
214 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  23.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  27.03 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  29.45 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  20.25 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  19.18 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  23.81 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  19.58 
 
 
153 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  21.54 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  23.58 
 
 
168 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  30.48 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  30.48 
 
 
182 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  34.48 
 
 
152 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  21.92 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  19.73 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  24.82 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  22.63 
 
 
159 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  32.76 
 
 
127 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  19.85 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.58 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  20.57 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  21.43 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  29.09 
 
 
168 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  18.46 
 
 
137 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  21.01 
 
 
327 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  24.77 
 
 
145 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.507009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>