167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1379 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  100 
 
 		 155 aa  304  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  89.47 
 
 		 152 aa  276  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  81.82 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  74.84 
 
 		 156 aa  236  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  75.48 
 
 		 156 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  80.95 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  73.55 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  73.55 
 
 		 156 aa  226  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  74.68 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  72.73 
 
 		 153 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  69.68 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  46.97 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  43.7 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  40.41 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  40.41 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  40.56 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  41.43 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  36.3 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  35.57 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  35.48 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  43.26 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  35 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  40.97 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  43.17 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  43.8 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  43.17 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  39.58 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  35.48 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  42.14 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  32.16 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  36.69 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  38.57 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  40.6 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  41.48 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  32.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  41.01 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  35.07 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  36.88 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  39.57 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  34.93 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  40.16 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  37.68 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  37.8 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  35.76 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  35.66 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  34.97 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  39.07 
 
 		 285 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  29.87 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  40.97 
 
 		 289 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 327 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  33.33 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  39.07 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  39.57 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  39.07 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  34.97 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  36.09 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  38.51 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  38.51 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  28.85 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  36.62 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  37.04 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  37.84 
 
 		 302 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  31.55 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  37.3 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  37.3 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  32.21 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>