42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1411 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  72.18 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  72.18 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  37.16 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  32.57 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  33.19 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  29.12 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  30.21 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  29.21 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  29.06 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  30.08 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.04 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.29 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  24.76 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  22.97 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  21.66 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  24.15 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.67 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  23.19 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  21.26 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  21.13 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  22.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.43 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  18.5 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  24 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  22.76 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  26.2 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  22.14 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  24.67 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  28.18 
 
 		 198 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>