98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1334 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  58.4 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  36.67 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  37.36 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  36.23 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  36.6 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  35.85 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  35.85 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  35.85 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  35.85 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  35.47 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  35.47 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  35.47 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  35.19 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  35.37 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  29.71 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  24.69 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  26.3 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  35.27 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  26.3 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.96 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.91 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.91 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  37.13 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  24.9 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.28 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  39.53 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  41.58 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  28.02 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  22.98 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.93 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.63 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  31.79 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  26.52 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.43 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  32.52 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  32 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  29.14 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  36.57 
 
 		 152 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 161 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  31.89 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  36.96 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  36.96 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  24.67 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  21.98 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  27.53 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  42.25 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  32.93 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  35.87 
 
 		 183 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  32.67 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  29.17 
 
 		 155 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.08 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  25.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.96 
 
 		 151 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  28.74 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  38.04 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.83 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  27.86 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  37.33 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  27.14 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 150 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  27.14 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 161 aa  46.2  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  27.92 
 
 		 176 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  30.5 
 
 		 150 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  30.34 
 
 		 195 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  35.16 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  30.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  21.63 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.81 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  21.63 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 178 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  34.44 
 
 		 168 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.7 
 
 		 162 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  31.37 
 
 		 161 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 202 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  30 
 
 		 153 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>