117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3117 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  84.04 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  50 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  45.45 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  34.3 
 
 		 253 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  34.26 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  32.57 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  38.81 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.28 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.19 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  36.6 
 
 		 179 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.23 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  33.93 
 
 		 192 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  37.95 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  36.24 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  40.67 
 
 		 170 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  27.51 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  37.93 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  39.53 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  38.24 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  34.69 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  38.85 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  36.73 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  36.73 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.05 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  35.62 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35.22 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  36.75 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  38.89 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  41.06 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.25 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  23.11 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.81 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  37.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.83 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  38.57 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  24.76 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  35.95 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  40.82 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  37.16 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  36.7 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  37.31 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.77 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  21.32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  31.41 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  22.84 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  21.23 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  20.75 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  20.28 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  34.27 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  30 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  39.81 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  39.23 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  34.01 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  20.28 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  20.28 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  31.79 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.53 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  32.69 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  24.85 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  29.53 
 
 		 161 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  29.52 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.86 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  27.62 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 160 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  31.41 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 163 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  37.01 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.6 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>