186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0012 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  100 
 
 		 150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  41.22 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  40.54 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  37.59 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  38.41 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  38.24 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  34.75 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  38.19 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  39.1 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  35.46 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  33.57 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.63 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  36.88 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  36.81 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  34.75 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  37.06 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32.21 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.21 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  36.64 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.89 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  36.64 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  35.66 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  33.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  32.37 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  30 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  35.34 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  30.88 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  31.41 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  34.51 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  37.41 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  37.06 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  32.17 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  34.01 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 166 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  30.51 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  30.51 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  33.8 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  23.74 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  28.86 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.06 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.8 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  29.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>