108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4641 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  100 
 
 		 156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  76.97 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  76.97 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  67.11 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  57.82 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  56.21 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  57.97 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  51.08 
 
 		 235 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  55.56 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  47.44 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  49.64 
 
 		 262 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  51.08 
 
 		 235 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  51.77 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  48.67 
 
 		 297 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  48.67 
 
 		 297 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  48.59 
 
 		 325 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  48 
 
 		 302 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  46.62 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  46.71 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  48.67 
 
 		 285 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  52.9 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  51.11 
 
 		 293 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  50.37 
 
 		 293 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  50.36 
 
 		 289 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  45.95 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 327 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  47.45 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  46.15 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  46.58 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  39.01 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  37.09 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  44.2 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  34.69 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  35.46 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  34.69 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  36.67 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  43.51 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  34.69 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  36.05 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  40.54 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  37.68 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  41.26 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  37.31 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  32.19 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  38.46 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32.43 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  36.96 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  35.81 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  36.05 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  33.58 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.34 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  27.74 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  36.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  35.56 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  34.03 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  26.97 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  29.66 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  30.57 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  25.42 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  25.95 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  35.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  35.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  29.85 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  24.73 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.86 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  28.48 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  36 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  26.88 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  23.08 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  25.44 
 
 		 373 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  25.44 
 
 		 373 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  33.76 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  29.37 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  20.12 
 
 		 164 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>