133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3352 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  293  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  293  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  76.97 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  65.13 
 
 		 158 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  54.73 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  54.73 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  55.48 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  51.03 
 
 		 262 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  55.56 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  51.05 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  54.79 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  48.28 
 
 		 235 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  49.66 
 
 		 235 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  49.31 
 
 		 302 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  48.61 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  47.89 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  48.61 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  48.61 
 
 		 297 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  48.61 
 
 		 297 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  46.31 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  47.62 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  46.53 
 
 		 293 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  47.22 
 
 		 293 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  45.58 
 
 		 327 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  46.53 
 
 		 289 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  44.52 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  45.83 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  44.06 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  46.21 
 
 		 185 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  43.8 
 
 		 153 aa  106  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  44.31 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  41.03 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  40.79 
 
 		 172 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  45 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  38.73 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  40 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  34.67 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32.19 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  39.44 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32.19 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  39.44 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  32.41 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  31.51 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  34.31 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  39.06 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  37.23 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.19 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  34.56 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  36.17 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  33.1 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  33.57 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  33.79 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  29.66 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.5 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  27.01 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  36.22 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  26.32 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  25.83 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  25 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  26.35 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  34.35 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  34.35 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  23.84 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.34 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  25.19 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  25 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  25 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  22.3 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  23.3 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  27.81 
 
 		 373 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  28.89 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  27.15 
 
 		 373 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  31.82 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  19.87 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  28.66 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>