143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3947 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  61.54 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  60.14 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  58.04 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  56.21 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  55.48 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  55.48 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  51.01 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  48.92 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  45.65 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  46 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  44.52 
 
 		 235 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  44.52 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  42 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  42.96 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  42.96 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  43.36 
 
 		 262 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  45.86 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  45.86 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  45.86 
 
 		 293 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  45.86 
 
 		 293 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 325 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  45.86 
 
 		 302 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  41.26 
 
 		 327 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  45.11 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  43.79 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 289 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  40 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  35 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  38.19 
 
 		 182 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  35.48 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  42.55 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  40.71 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  38.85 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  40.43 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  38.57 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  39.29 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  39.29 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  37.41 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  39.29 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  37.86 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  38.03 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  33.83 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  37.86 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  37.12 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  32.12 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  32.92 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  38.78 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34.04 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  31.61 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  41.04 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  41.04 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.39 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  30.52 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  29.87 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  27.69 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  26.59 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  25.84 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  35.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  30.15 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  34.01 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  23.7 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>