176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1474 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  100 
 
 		 152 aa  310  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  32.03 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  36.24 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.78 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  29.5 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  35.53 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  29.93 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  29.94 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  28.77 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  34.81 
 
 		 271 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  28.39 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  35.66 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  24.5 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  32 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  27.44 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  31.34 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  29.87 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  27.66 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  30 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  28.18 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  28.29 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  29.93 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  24.11 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  27.82 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  28.04 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  31.91 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  27.96 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  26.28 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  27.59 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  27.91 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  25.55 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  27.97 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  24.29 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  30.63 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  25.74 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  33.68 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  26.57 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  25.16 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  24.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 289 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  27.92 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  26.12 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  25.58 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  27.06 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  27.52 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  25.29 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  27.21 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  27.21 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  27.33 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>