86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2490 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  46.97 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  45.63 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  35.11 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  32.44 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  33.94 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  30.19 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  30.21 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  30.74 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  30.74 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  30.27 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  33.03 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  23 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  25.13 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  23.66 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.37 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  24.27 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  29.69 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  32.84 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  24.21 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.68 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  26.57 
 
 		 152 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  33.66 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  22.76 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  34.26 
 
 		 168 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  23 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  31.4 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  24.44 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  22.73 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  31.88 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  26.32 
 
 		 161 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  31.78 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.8 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  26.92 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 137 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.22 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 149 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 137 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  21.71 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 123 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  29.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  25.77 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  24.29 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  24.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  25.69 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  25.71 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  25.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  25.15 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  25.15 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  28.21 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  25 
 
 		 152 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  21.38 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25 
 
 		 159 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 257 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>