70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3722 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  46.62 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  47.22 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  46.81 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  47.45 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  47.3 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  41.89 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  38.67 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  28.26 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  23.27 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  24.14 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.36 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  31.34 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  29.69 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  31.2 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  21.74 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.85 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  27.21 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  23.08 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  23.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  29.85 
 
 		 212 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  23.02 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  22.45 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  20.89 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  26.09 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  26.81 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  25.83 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  26.98 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  25.93 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  25.2 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  22.56 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  23.23 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  25.66 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 150 aa  42  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  25.19 
 
 		 156 aa  42  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  26.79 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  23.64 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  22.14 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  19.08 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  24.48 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  23.24 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>