81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1022 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  46.62 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  47.22 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  46 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  42.36 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  48.23 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  49.62 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  41.84 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  41.55 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  24.82 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  24.63 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  26.57 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  31.79 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  27.2 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  27.39 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  25.87 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  21.43 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  27.39 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  27.63 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  23.53 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  25.68 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  23.36 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.23 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.97 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  26.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  24.26 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  23.78 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.15 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  27.27 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.32 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  27.93 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  25.9 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  28.18 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  28.09 
 
 		 271 aa  43.9  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  26.61 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  25.55 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  25.5 
 
 		 202 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  27.07 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  25.86 
 
 		 150 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  23.94 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  26.83 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  28.1 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  28.1 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  26.83 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  26.83 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  26.83 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.83 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  23.24 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  17.69 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.03 
 
 		 267 aa  40.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.81 
 
 		 217 aa  40.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>