78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0157 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  100 
 
 		 161 aa  323  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  33.99 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  30.97 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  25.55 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  34.45 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  34.45 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  34.45 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  28.67 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  26.87 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.48 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  33.08 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  28.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  32.84 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  40 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.84 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  24.46 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  27.73 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.43 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.56 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  40 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  34.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  34.09 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  29.01 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  30.61 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  41.43 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  25.5 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  29.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.21 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  30.65 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.58 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  37.84 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  25 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  31.85 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.38 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  35.8 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  38.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.42 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.65 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.45 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  25.38 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.97 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  29.75 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  28.03 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  24.62 
 
 		 210 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  23.53 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0987  hypothetical protein  23.49 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00724103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  24.64 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  28.29 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  31.71 
 
 		 271 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  21.54 
 
 		 267 aa  40.8  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  24.29 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>