176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0406 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  46.36 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  49.28 
 
 		 151 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  41.36 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  39.86 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  42.67 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  38.57 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  39.55 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  32.47 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.17 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  34.09 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.37 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.94 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.82 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  35.79 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  29.8 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  34.15 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  29.8 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  32.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.38 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  36.88 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  31.87 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  26.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  26.8 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  37.17 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  30 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  32.82 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  31.43 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  30.13 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.04 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  33.1 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  35.43 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  35.11 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  32.28 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.86 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  31.96 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  34.31 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  29.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  31.52 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  32.65 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  26.76 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  32.81 
 
 		 150 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  30.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32.88 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  28.93 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.84 
 
 		 271 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.03 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  31.37 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  31.75 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  32.99 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  32.94 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>