104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1159 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  100 
 
 		 129 aa  246  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  59.69 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  55.2 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  55.2 
 
 		 161 aa  123  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  54.47 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  34.59 
 
 		 271 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  37.82 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  39.53 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  36.57 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  32.59 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  35.61 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.12 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30.08 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.08 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  31.2 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  34.41 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  28.89 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  29.59 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  32.93 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  25.58 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  29.55 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  31.2 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  38.27 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  26.09 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.94 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  35.56 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  32.18 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  32.18 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  32.09 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  38.82 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  30.39 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  34.83 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  34.83 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  32.12 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  31.4 
 
 		 257 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  26.92 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  26.02 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  30.85 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  23.66 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  26.36 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  24.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  30.25 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  29 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  26.62 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  26.62 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  23.45 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  31.11 
 
 		 271 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  25.9 
 
 		 166 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  30.59 
 
 		 198 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1693  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  28 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>