133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0147 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  100 
 
 		 159 aa  307  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  66.89 
 
 		 155 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  49.31 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  44.74 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  42.18 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  43.54 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  43.7 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  34.03 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.25 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  39.42 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  39.86 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  30.46 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  35.81 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  36.99 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  35.9 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  38.76 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  35.9 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  35.9 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 253 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.37 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  30.32 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  35.29 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  34.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  34.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  35.25 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  34.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.57 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  34.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  35.25 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  34.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  31.94 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  35.25 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  33.76 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  33.76 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.68 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  33.76 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  33.76 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.65 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  34.93 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31.55 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  35.14 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.72 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  26.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  31.18 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  31.18 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  31.18 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  28.87 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.22 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  39.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  30.57 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  30.59 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  26.71 
 
 		 373 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.15 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  32.84 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  33.78 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  26.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  28.95 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  26.09 
 
 		 373 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  33.77 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.81 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  34.44 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  22.22 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  33.83 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  29.66 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  38.64 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>