192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0221 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  100 
 
 		 152 aa  296  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  51.75 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  50.34 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  49.31 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  44.67 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  41.5 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.96 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  38.57 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  42.67 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  37.33 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  36.6 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  41.06 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  33.78 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  36.5 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  39.47 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  34.33 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  34.01 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  30.52 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  38.57 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  36.43 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.41 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  35 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.9 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  34.18 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  34.59 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  33.73 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  39.74 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  30.61 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  32.59 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  33.81 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  35.51 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  30.92 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  35.14 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  35.04 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  30.49 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35.1 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  30.86 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.85 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  32.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  36 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  36 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  29.79 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  33.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  33.57 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  33.81 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  30.6 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.95 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  34.27 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34.04 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  35 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  34.27 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.95 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  35.92 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  34.27 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  36.57 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  33.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  30.17 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  32.5 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  31.85 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  32.5 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  32.5 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  35.92 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  31.79 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>