138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1220 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  100 
 
 		 199 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  67.72 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  57.05 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  52.6 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  51.63 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  52.76 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  50.27 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  53.29 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  46.01 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  51.63 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  47.33 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  50 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  48.45 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  43.24 
 
 		 357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  52.12 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  47.71 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  47.4 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  40.7 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  44.97 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  39.58 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  41.76 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  39.58 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  39.06 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  46.05 
 
 		 174 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  50 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  45.7 
 
 		 338 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  41.72 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  41.38 
 
 		 160 aa  89  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  42.63 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  37.77 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  47.66 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 253 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  48.45 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.91 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  45.21 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  38.3 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  34.81 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.94 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  36.81 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  38.93 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  34.31 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.57 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.74 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  36.23 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  29.33 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  38.41 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  36.17 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  37.68 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.36 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.4 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  39.31 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  38.19 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  32.08 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.94 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  35.57 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.42 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  38.16 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  37.6 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  35 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  24.32 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  36.81 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  41.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  43.93 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  21.94 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  21.74 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.65 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  35.66 
 
 		 163 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.54 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  21.28 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  17.95 
 
 		 258 aa  51.6  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  21.38 
 
 		 153 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  34.07 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  37.63 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  23.57 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  32.85 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  38.14 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  37.65 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  35.88 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  34.46 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  37.65 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  27.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.28 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  34.01 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>