111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3247 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  100 
 
 
179 aa  350  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  32.03 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  34.67 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  35.29 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  37.41 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  31.54 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.75 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  37.58 
 
 
152 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  36.36 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.69 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  32.3 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  23.27 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  31.72 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  27.63 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  34.33 
 
 
154 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.21 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  30.53 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  30.19 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  35.21 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  30.87 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  32.41 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.11 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  30.32 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  37.63 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.33 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35.53 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  30.2 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  30.2 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  26.28 
 
 
153 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.32 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  28.4 
 
 
265 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  34.06 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  30.94 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  36.56 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  21.92 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.26 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  23.08 
 
 
160 aa  52  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  35.42 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.82 
 
 
168 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  34.44 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  31.4 
 
 
269 aa  50.8  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.86 
 
 
149 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27.78 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  34.97 
 
 
338 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  30.88 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.16 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  27.08 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  33.14 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  35.56 
 
 
129 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.83 
 
 
271 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  31.93 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  26.35 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  20.74 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.73 
 
 
253 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  32.84 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  47.8  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  29.3 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  20.25 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  24.5 
 
 
270 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  29.93 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.14 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  32 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  26.28 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  30.53 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  28.4 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.41 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  28.09 
 
 
271 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  30.3 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  25.53 
 
 
270 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  34.18 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.88 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  28.1 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  24.82 
 
 
270 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  28.68 
 
 
262 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.85 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  22.96 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  25.74 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.82 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  27.59 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  31.33 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  30.15 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  24.83 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  24.83 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  34.04 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  29.75 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  24.24 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  25.93 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  23.94 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  24.83 
 
 
228 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  28.68 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  29.09 
 
 
164 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>