88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3918 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  100 
 
 		 222 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  55.32 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  57.78 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  59.75 
 
 		 163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  55.08 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  59.44 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  55.56 
 
 		 254 aa  147  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  51.58 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  51.37 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  54.9 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  49.43 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  48.02 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  45.05 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  49.69 
 
 		 357 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  47.17 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  49.7 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  51.63 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  50.96 
 
 		 160 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  55 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  46.29 
 
 		 184 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  49.34 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  45.78 
 
 		 183 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  43.43 
 
 		 183 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  43.82 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  45.78 
 
 		 183 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  45.73 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  53.79 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45.51 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  40.22 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  42.14 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  47.76 
 
 		 137 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.13 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.32 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  41.82 
 
 		 127 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.2 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.21 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  36.99 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  34.3 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.77 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  22.76 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.15 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  36.7 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.71 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  22.45 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  28.03 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  48.5  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  36.13 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  27.1 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  36.23 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  22.14 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  30.97 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.14 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  23.24 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  29.82 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  20.25 
 
 		 163 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  41.3 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  33.04 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  29.08 
 
 		 168 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  28.49 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  23.08 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  29.87 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.45 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  37.18 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  21.82 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  22.28 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  23.58 
 
 		 271 aa  41.6  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>